不登校は、主に精神障害の存続、悪化に関連している。
予後良好な要因には、
①症状の急性発症
②発症時の年齢が若い
③学校に通っていない時間が短い
④早期診断と治療
⑤精神医学的罹患率の低下
⑥不登校の頻度が少ないことが挙げられる。
逆に、不登校が慢性化するリスクは、援助が迅速に行われず保護的な要因が欠けている場合に増加する。